Non-coding RNA方向美国自然科学基金标书摘要2018年10篇精选


1. Identification and Functional Dissection of Long Non-Coding RNAs in Genomic Imprinting


编号:9424417项目类型:5F32HD090833-02单位:MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY
年度:2018项目金额:$39323国家:美国

项目负责人:WHIPPLE, AMANDA JOY;



该提案解释了长非编码RNA(lncRNA)在基因组印记表观遗传现象中的作用。印记基因表达富集于大脑并最终影响神经元信号传导,分化和存活。值得注意的是,源自差异甲基化区域的lncRNAs对于几种印记基因的适当单等位基因表达是功能性需要的。 lncRNAs在建立和维持基因组印记方面的详细研究将对印记的疾病,如Angelman综合征产生重大影响,这是由于母亲Ube3a丧失所致。 Ube3a的父亲拷贝在患者中完好无损,但被称为Ube3a ATS的神经元特异性抑制性lncRNA沉默。虽然作用机制尚不清楚,但已经证明,抑制Ube3a ATS部分恢复了Angelman综合征中的Ube3a。迄今为止已鉴定了100多种印迹蛋白编码基因,对印迹位点上的lncRNAs的综合研究将增加我们对lncRNA介导的基因调控的机理理解。在此,在具体目标1中,将建立允许等位基因特异性转录组表征的体外神经元分化系统。来自不同小鼠亚种的相互交叉的胚胎干细胞将被收获并分化成神经元谱系。在具体目标2中,这个独特的模型系统将用于在印迹基因座上鉴定新颖的lncRNA。转录组测序和等位基因特异性单核苷酸多态性的比对将用于分配表达中的等位基因偏差。在具体目标3中,将确定Ube3a ATS调节Ube3a的印记表达的分子机制。 CRISPR / Cas9靶向策略将用于功能性解剖Ube3a ATS在神经元中Ube3a的表观遗传和转录控制中的活性。本研究的长期目标是利用印迹lncRNAs的基础活性来治疗性调节神经发育障碍中的印迹基因。



2.  Long Non-Coding RNA-mediated Differential Regulation of Notch Pathway Targets in Early T-cell Development



编号:9438382项目类型:5F30HL136080-02单位:CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY
年度:2018项目金额:$49044国家:美国

项目负责人:BANERJEE, ABHIK ;


Notch信号传导对早期T细胞发育至关重要。 Notch信号的核心是依靠Notch家族受体与其同源物,跨膜结合的Delta样家族配体之间的相互作用。在配体识别和结合后,Notch受体经历一系列蛋白水解切割事件,允许Notch胞内结构域(NotchICD)释放和易位到细胞核中。在细胞核内,NotchICD可以与其DNA结合配偶体重组信号结合蛋白Jk(RBPJk)相互作用以激活靶基因的表达。尽管Notch介导的基因调控在这种发育背景下发挥了至关重要的作用,但由于NotchICD的表达模式接近一致,NotchICD如何定位于DNA并差异调控基因表达,这仍然是一个谜。 Notch信号传导的一个重要负调控因子是Spen。已显示Spen与NotchICD竞争RBPJk结合并可招募共抑制复合物以重塑染色质并抑制基因组基因座。最近,Spen被证明与一组称为长非编码RNA(lncRNA)的核酸分子直接相互作用。考虑到它们在细胞核中的优先定位,通过蛋白质支架协调核组织的能力,以及记录的组织和时间特异性高于mRNA或蛋白质,lncRNA是一种有吸引力的且尚未表征的类调节分子,其可介导Notch的差异表达目标基因。我们推测lncRNA招募Spen到DNA上不同的RBPJk结合位点。这反过来又将NotchICD偏向“未被占据”的RBPJk位点,导致靶基因的激活。 lncRNA表达的变化将调节Spen定位并以阶段和时间特异性方式改变NotchICD的可获得的基因组库。我们将通过使用染色质免疫沉淀来表征NotchICD和Spen基因组定位的动力学,确定Spen与RNA的相互作用是否对使用Spen截短分析调节Notch信号传导至关重要,以及表征特定lncRNA Spen相互作用对Notch差异表达的作用目标基因使用遗传扰动,在体外分化pro T细胞亚群。本研究的结果有可能将lncRNA纳入我们对发育和分化过程中动态基因调控的理解中,并将其推广到其他生物环境中的信号传导途径。此外,Notch信号传导途径的调节异常与多种血液学和实体恶性肿瘤有关,包括T急性淋巴细胞白血病和胰腺癌。通过鉴定和表征新型lncRNA Spen相互作用在这项研究中,我们希望找出新的,越来越具体的目标药物操纵的Notch信号通路治疗人类疾病。


3. Mechanistic investigation of long non-coding RNAs in Drosophila oogenesis


编号:9428961项目类型:5F32GM122349-02单位:NORTHWESTERN UNIVERSITY
年度:2018项目金额:$59166国家:美国

项目负责人:NYBERG, KEVIN GLENN;



长的非编码RNA(lncRNA)是一种长于200个核苷酸的松散定义的RNA类型,构成了真核转录组的重要部分。成千上万的lncRNA现在已经在许多物种中进行了编目,但相对较少的功能特征,特别是在动物模型中。由于缺乏lncRNA功能的分子证据和lncRNA保守信号一直较弱,它们对机体生物学和疾病的影响程度仍不清楚;为了充分理解lncRNA生物学,动物模型中更多的功能研究是必要的。本提案的长期目标是在经典动物模型:果蝇(Drosophila melanogaster)中调查lncRNA在卵子发生的关键发育过程中的功能。果蝇卵子发生的遗传学和发育已被充分表征,有助于调查lncRNA如何影响特定的发育过程并与关键的卵子发生基因相互作用。此外,卵子发生的许多方面在所有动物中共享,因此对果蝇lncRNA生物学的洞察将为人类生物学提供信息。该提案有三个具体目标。首先,卵巢富集lncRNA的定位将在卵子发生中表征。已有的果蝇卵巢RNA Seq数据集的分析已经鉴定了28个反义和基因间的lncRNA基因座,这些基因座在卵巢中富集并可能在多种果蝇物种中保守,这提示了功能重要性。这些lncRNA在整个卵子发生过程中的细胞和细胞内定位将使用单分子荧光原位杂交(smFISH)来确定。其次,将对lncRNA突变体表征生殖表型。像靶向基因缺失的标准突变方法通常不足以用于研究lncRNA功能,因为重叠的DNA调控元件是常见的并且可能混淆解释。相反,该提案旨在开发和实施特异性靶向lncRNA转录本的突变方法。第三,将表征lncRNA功能的机制。 lncRNA突变体和野生型苍蝇之间的比较RNA Seq实验将揭示lncRNAs的特定调控靶标以及lncRNAs是否以顺式或反式发挥作用。 RNA / DNA双重FISH将用于确认lncRNAs及其靶标的调控相互作用,并且使用RNA聚合酶II抑制剂跟踪smFISH进行处理将揭示lncRNA活性是由于RNA产物还是由新生RNA转录本身引起的。该提案的成功完成将为lncRNA生物学提供重要见解。由于许多lncRNAs也与心血管疾病和癌症等疾病相关,因此从果蝇中获得的知识将对了解lncRNA如何促成人类疾病有价值。


4. Long non-coding RNA signatures to distinguish fibromyalgia syndrome from rheumatic diseases


编号:9555179项目类型:2R44AI129147-02单位:IQUITY LABS, INC
年度:2018项目金额:$498258国家:美国

项目负责人:AUNE, THOMAS M.; SPURLOCK, CHARLES FLOYD (contact);



与风湿性疾病相比,没有其他疾病包含更多的病理生理学。跨越多器官系统,临床决策通常依靠初级保健提供者和风湿病学家的协调努力,以在治疗类风湿性关节炎(RA)和系统性红斑狼疮(SLE)等炎症性疾病时排除或排除鉴别诊断。 RA是一种对称性,炎症性,外周性多关节炎,通过骨骼和周围软骨的侵蚀导致关节畸形。 SLE几乎可以影响任何导致疲劳,发热,肌痛,体重变化以及肾,中枢神经系统和血液系统相关并发症的器官,这些器官可能会危及生命。排除其他诊断后,RA和SLE通过临床判断进行诊断。在这两种疾病的情况下,单个实验室检测仅对部分疾病人群有效。在这些分析中,这些实验室测量的敏感性和特异性可能对SLE规则具有高度特异性,但由于这些诊断标记可能在其他疾病中发现,因此缺乏敏感性。正如一位医生的同事指出的那样,“诊断阴性很难”。 RA和SLE的诊断方法通常依靠多个独立的实验室检查结合临床观察。鉴于这些疾病的治疗方法不同,区分这些疾病很重要。时间是诊断这些疾病的一个因素,需要工具来促进早期诊断,因为自身免疫性疾病的治疗非常有效,并且早期开始治疗可以产生最佳结果。这些疾病的误诊并不罕见。风湿病学家看到的另一种常见疾病是纤维肌痛症(FMS)。 FMS是广泛肌肉骨骼疼痛的常见原因,影响肌腱,韧带和肌肉。 FMS很难诊断和治疗,临床重要的一点是FMS不能被另一种风湿性或全身性疾病所解释。因此,一旦考虑并排除其他病因,FMS就是排除的诊断。 RA和SLE是必须从鉴别诊断中消除的两种疾病。鉴于复杂的诊断过程,这些患者往往不得不忍受,最近的研究也表明,诊断后可节省医疗保健费用,并改善患者结局。迄今为止,还没有实验室检测可以确定单一血液样本中是否存在这三种情况。几年以来,基于全血中mRNA的疾病特异性表达水平能够建立能够提供临床有用信息的疾病分类器的问题一直是研究的主题。长的非编码RNA(lncRNA)是最近发现的调控RNA分子,其不编码蛋白质但影响大量生物过程。人们也认为lncRNA驱动脊椎动物中观察到的生物复杂性,这也可能反映在人类发展起来的更复杂的特发性疾病中。因此,我们在这项工作的第一部分中获得的数据支持这样一种观点,即疾病相关lncRNA在表达方面表现出比疾病相关mRNA更大的差异。在这个应用中,我们建议探索lncRNAs比mRNA更好的人类疾病生物标志物的假设。在这里,我们将重点关注FMS和风湿性疾病作为疾病类别,并确定并验证FMS和风湿性疾病相关的差异表达的lncRNAs。人类自身免疫性疾病中的lncRNAs的研究尚处于起步阶段,对lncRNAs的研究作为自身免疫性疾病的生物标志物尚未得到解决。我们建议确定从较大群体受试者获得的血液中靶标lncRNA的表达水平,所述一组受试者包括1)具有纤维肌痛综合征的受试者,2)健康对照,3)类风湿性关节炎,4)系统性红斑狼疮,以及5)从美国和欧洲各地获得的外周自身免疫疾病对照,以建立广泛的地理分布并鉴别最佳机器学习分类器以区分纤维肌痛综合征和风湿性疾病与健康和 疾病控制队列具有最高的整体准确性。



5. Project 1 KSHV-encoded Inc RNAs and alteration of host IncRNA expression


编号:9429077项目类型:5P01CA214091-02单位:UNIVERSITY OF FLORIDA
年度:2018项目金额:NA国家:美国

项目负责人:RENNE, ROLF F;



卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)是一种人类γ疱疹病毒,是KS和原发性渗出性淋巴瘤(PEL)等AIDS恶性肿瘤的病原体。近年来,很明显包括EBV,KSHV和MHV68的病原性疱疹病毒表达许多长的非编码RNA(lncRNA),其中许多与蛋白质编码转录物反义方向。这些RNA的功能和结构在很大程度上是未知的。另外,这些病毒表达微小RNA(miRNA)。在表征KSHV miRNA靶标体的同时,我们确定了数百个宿主细胞lncRNAs为推定的miRNA靶标。此外,用wtKSHV感染内皮细胞诱导了宿主lncRNA的显着的不正常调节,包括533 lncRNA的下调。当这些细胞被KSHV重组体缺乏12个KSHV miRNA中的10个感染时,这126个细胞被拯救出来。这些数据一起强烈表明,KSHV编码的蛋白质和miRNA有助于宿主lncRNA的失调。重要的是,据报道,在KSHV感染后受到干扰的10种lncRNAs包括HOTTIP,ANRIL,Meg3和UCA1与人类癌症有关。我们证明UCA1的上调影响KSHV感染的内皮细胞的增殖和迁移。此外,我们提供了反义LANA转录本与EZH2 / PRC2复合物结合并可能有助于调节病毒潜伏期的实验证据。这些数据表明病毒lncRNAs是病毒基因表达的重要调节因子,因此可能对病毒发病机制和/或肿瘤发生很重要。为了理解lncRNA在病毒生物学中的作用,我们建议功能性研究病毒lncRNA并确定KS发病机制中宿主lncRNA失调的潜在机制和表型后果。重要的是,在适当的淋巴和内皮来源的组织培养模型中观察到的实验结果将与Chris Parsons博士合作,使用AIDS恶性肿瘤临床标本进行验证。此外,该项目将与项目2(EBV)和3(MHV68)密切合作进行,目标是确定通常由癌症相关γ疱疹病毒lncRNA调控的途径。识别这种常见的调控途径可能指向新的病毒特异性治疗策略。我们注意到迄今为止,几种基于miRNA和lncRNA的疗法处于临床开发的不同阶段。



6.Structure, Function and Targetability of RNA Excited States


编号:9512576项目类型:5F31GM119306-02单位:DUKE UNIVERSITY
年度:2018项目金额:$35086国家:美国

项目负责人:GANSER, LAURA R.;



由于非编码RNA(ncRNA)越来越多地涉及细胞功能以及疾病状态,因此需要加深我们对RNA结构 - 功能关系的理解以及开发用小分子靶向RNA的方法。传统观点认为,ncRNA折叠成单一明确的二级结构最近受到NMR弛豫分散实验的挑战,表明非规范RNA基序与被称为“激发态”(ES)的替代高能二级结构处于动态平衡状态。诱变研究表明绝大多数RNA分子存在RNA ES。 RNA ESs的显着改变的结构与改变的生物活性相关,这可能为新的基于RNA的转换开关提供基础。此外,由于ES为非经典错配交易规范的沃森 - 克里克碱基对,它们的结构是独特且复杂的,可能为发现以高亲和力和选择性结合RNA的小分子提供新的受体。用小分子捕获非活性ES构象的RNA可能导致RNA-定向药物发现的新策略。然而,RNA ESs对传统的结构和功能表征技术提出了独特的挑战,因为它们短暂存在于低丰度中。我们建议开发一种新的范例,以结构和功能特征描述RNA ESs,以及测试它们作为药物靶标的适合性,并将其特定应用于最近在人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)反式激活中发现的两种ES之一应答元件(TAR)RNA。目标1将通过使用诱变方法稳定ES构象并测试诱捕ES的突变显着改变TAR在HIV-1转录中的活性的假设来验证TAR ES作为治疗靶标。目标2将使用结合X射线晶体学,NMR和分子动力学模拟的新策略来解决TAR ES的动态结构集合。目标3将使用结构引导的方法来鉴定结合并稳定TAR ES的新型抗HIV小分子。这项工作将有助于评估RNA ES作为新的药物靶点,并为其他RNA ES的结构和功能表征奠定基础。



7. TDP-43-regulated microRNAs and TDP-43 Proteinopathy


编号:9382912项目类型:5F30NS090893-04单位:NORTHWESTERN UNIVERSITY AT CHICAGO
年度:2018项目金额:$40644国家:美国

项目负责人:MCGEE, WARREN ALEXANDER;



Tar DNA结合蛋白,43 kDa,(TDP-43)是一种多功能的DNA / RNA结合蛋白。 TDP-43蛋白病是包括肌萎缩侧索硬化(ALS)和额颞叶变性(FTLD)病例的神经退行性病症的异质谱。像其他神经退行性疾病一样,TDP-43蛋白病表现出相当大的社会负担,但缺乏早期诊断工具或疾病缓解疗法。证据支持TDP-43的突变或失调导致TDP-43蛋白病的想法。然而,TDP-43的生物学功能和TDP-43导致TDP-43蛋白病的分子机制仍有待阐明。尚未完全探索的一个方面是microRNA的作用。微小RNA(即miRNA)是一类通过结合它们并使它们不稳定而调节mRNA靶标的非编码RNA。每个miRNA可以靶向数十个mRNA,每个mRNA可以被多个miRNA靶向。因此,miRNA-mRNA相互作用的复杂网络出现在任何细胞中。虽然已知TDP-43调节miRNA生物发生,哪些miRNA被调节,它们的生物功能是什么以及它们是否在TDP-43蛋白病的发病机理中起作用尚未系统表征。为了解决这些问题,这个提案有两个目的。在第一个目标中,将从小鼠皮层神经元收集miRNA表达谱以确定在TDP-43敲低后哪些miRNA改变。然后,将在此敲减模型以及实验室开发的TDP-43蛋白病的细胞小鼠模型中以及来自TDP-43的死后脑组织样品中收集miRNA和mRNA的成对表达谱蛋白病患者。利用这些配对的表达谱,生物信息学方法将被用于首先预测miRNA-mRNA相互作用的发生。然后它会预测哪些特定的miRNA和mRNA对四种影响最大(TDP-43聚集,神经元存活,轴索完整性和线粒体功能)在TDP-43蛋白病中失调。 在第二个目标中,实验将解决调节三个预测的miRNA和三个靶基因的相互作用是否会影响四个功能域。 该实验室最近开发了一种新型微流体腔室,采用耦合算法,可用于以无偏和有效的方式评估轴突完整性。 该实验室还建立了细胞生物学,成像和生化分析以研究其他功能域。 从这两个目标收集到的见解将有助于了解TDP-43的生物学功能和TDP-43蛋白病的发病机制,从而帮助开发早期诊断工具和疾病缓解疗法。


8. Characterization of a novel RNA-guided endoRNAse and applications towards genome-wide screening for non-coding RNA roles in melanoma resistance


编号:9320182项目类型:5F30CA210382-02单位:HARVARD MEDICAL SCHOOL
年度:2018项目金额:$48576国家:美国

项目负责人:ABUDAYYEH, OMAR O;



RNA在生物学中扮演着不同的角色,但是我们完全理解其细胞角色的能力受到缺乏研究和操纵RNA的工具的限制。非编码RNA已经成为细胞生物学中的关键调控因子,并且包括通过Argonaute依赖性RNA降解和数千个长基因间非编码RNA(lincRNA)调节mRNA表达的小干扰RNA和微RNA,其通常用于调节基因表达,表观遗传状态和转录后过程。哺乳动物基因组编码数以万计的lincRNA,尽管它们在基因表达中具有不同的调控作用,尤其是在癌症的正向和负向两个方向上,但是lincRNA在癌症抗性中是否发挥重要作用仍是未知的。虽然BRAF抑制剂维拉非尼在黑素瘤中可见显着的临床效果,但它们由于耐药性而失败。全基因组获得和丧失功能的汇集筛选揭示了许多与使用体外黑素瘤细胞系模型的vemurafenib抗性相关的基因,但是lincRNA在黑素瘤抗性中的作用仍不清楚。虽然存在许多RNA靶向工具来研究这些过程,但没有一个是理想的。例如,siRNA具有较差的特异性并且不能靶向核RNA,例如lincRNA。最近,我们计算发现了新的CRISPR相关酶,并确定了一个新的家族C2c2,它具有显着的两个HEPN内切核糖核酸酶结构域的保守性,表明C2c2可能切割RNA。我将结合生物化学和细菌遗传技术来功能性地表征C2c2,设计用于哺乳动物应用的酶,并使用该工具用于审查黑素瘤中非编码RNA介导的抗性。在目标1中,我将从Leptotrichia shahii生物化学表征C2c2并鉴定RNA裂解的关键活性残基。可重编程的RNA的验证靶向将在体外使用纯化的蛋白质和使用大肠杆菌在体内证明。 在目标2中,我将筛选12个C2c2直向同源物以确定最活跃的RNA靶向酶。 然后,我将在哺乳动物细胞中表达人类密码子优化的顶部直向同源物版本以展示内源RNA切割并执行全转录组RNA测序以评估C2c2的特异性。 在目标3中,我将开发C2c2 crRNA的全基因组lincRNA文库,并在遭受BRAF抑制剂药物选择的黑色素瘤细胞系中进行敲低筛选。 我将验证命中并证明他们能够调节对BRAF抑制剂的敏感性。 该项目将开发一种可重编程的RNA靶向工具并研究非编码RNA在黑色素瘤耐药中的作用。 RNA靶向工具的可用性对于许多应用是有用的,并且理解黑素瘤抗性中的非编码相互作用对于开发更好的疗法是必不可少的。


9.Uncovering small RNAs that contribute to Coxiella burnetii infection


编号:9529169项目类型:1R03AI133023-01A1单位:PORTLAND STATE UNIVERSITY
年度:2018项目金额:$74250国家:美国

项目负责人:RAGHAVAN, RAHUL ;



非编码小RNAs(sRNAs),迅速而特异地起作用,是病原体如Coxiella burnetii中理想的基因调节剂,在不同环境(如气溶胶与细胞内)之间快速转换。然而,关于促进C.burnetii--一种导致急性Q热和慢性心内膜炎的选择剂的致病性的sRNAs知之甚少。重要的是,我们能够获得更好的分子生物学方面的见解,因为它在全球各地都有发现,并且有可能引起流行病,例如荷兰最近的爆发涉及超过4000例人类病例,并导致对50,000只山羊(主要水库)。我们的长期目标是定义C.burnetii感染期间非编码RNA的功能,并将这些知识应用于开发新的治疗方法。为了实现这一目标,本申请的目标是鉴定促进C.burnetii在人类细胞内生长的sRNA。根据初步的数据,确定了几个新的sRNAs在Cox-iella,我们的中心假设是,sRNAs促进细胞内生长C. burnetii。该项目的目标将通过两个具体目标来完成:(1)确定对Coxiella细胞内生长重要的sRNA。使用RNA-seq我们期望鉴定在不同的感染阶段表达的sRNA,并且通过检测转座子插入突变体,我们将检测它们对细胞内生长的重要性。 (2)定义sRNA CbsR14在促进Coxiella细胞内生长中的作用。为了开始了解sRNA如何促进感染,我们将询问CbsR14的功能,该sRNA选择是因为其表达在细胞内诱导,其中的转座子插入显着减少了Coxiella的细胞内生长,并且初步分析表明其靶向相邻yidC基因。迄今为止关于C. burnetii感染的所有研究都只进行了研究蛋白质;因此,此处提出的研究具有创新性,因为它将偏离现状来研究非编码RNA在促进柯塞氏菌感染中的作用。这项研究具有重要意义,因为它将首次确定促进C. burnetii细胞内生长的sRNA。通过改变我们目前对Coxiella致病性的理解,这一新知识有望在相当大程度上推动这一领域的发展。另外,发现YidC的调控电路可能适用于其他生物体,因为这种膜蛋白在细菌和线粒体中是保守的。此外,我们在这个项目中开发的方法将指导我们(和其他人)分析Coxiella中其他类别的非编码RNA(例如核糖开关),并检查其他难治性细胞内病原体如衣原体,立克次氏体,无形体和埃立克体中的sRNA 。此外,更深入地了解基于sRNA的基因调控可能有助于开发靶向sRNA调节子关键组分的新型抗Coxiella治疗剂。


10.Unraveling regulatory functions of circRNAs at the muscleblind locus



编号:9364300项目类型:1R01GM124406-01单位:BRANDEIS UNIVERSITY
年度:2017项目金额:$325000国家:美国

项目负责人:KADENER, SEBASTIAN ;



。因此,RNA代谢紊乱与许多肌肉和神经退行性疾病(包括肌强直性营养不良(MD)和肌萎缩侧索营养不良(ALS))之间存在紧密联系并不令人惊讶。例如,MD-1由CTG重复序列的扩增引起,这导致由基因肌肉结合蛋白-1编码的剪接因子MBNL1的隔离(sequestration)。 MBNL1和MBL家族的另一成员(MBNL2)在RNA加工和运输中具有重要的和重叠的功能,特别是在肌肉和神经元中。环状RNAs(circRNAs)是非常丰富的,没有很好表征的非编码RNA类型。这些RNA由特定外显子的环化产生,其功能仍有争议。我的实验室最近的工作已经证明,circRNA产生与前mRNA剪接竞争,表明circRNAS是基因表达的一般顺式调节子。我们通过MBL的研究发现了MBNL1的果蝇同源基因,该蛋白调节circRNA的一个子集的生产,包括从它自己的基因座(circMbl)产生的一个子集。引人注目的是,我们注意到MBNL1的相同外显子在人类中产生了circRNA,并且哺乳动物中的circMb1产生也可以由MBL诱导。来自我实验室的其他未发表的作品表明,翻译了一部分circRNA。这些翻译的circRNA之一是circMbl。另外,最近我们产生了第一组动物,其中特定的circRNA被下调。许多circRNA敲低菌株显示出强烈的发育和生理表型,首次证明了circRNA分子在体内的功能性。 circMbl敲低导致雄性胚胎致死率,翅膀姿势缺陷和突触小泡功能缺陷。在这里我们旨在解开circMbl生产和功能的分子和生理学影响。这项工作将导致circRNAs在体内的先驱功能特性,并将成为了解MBL生产和功能在体内如何被调控的关键。为此,我们将:表征MBL和circMbl之间的功能关系;确定circMb1表达的空间,时间和功能要求,并确定circMbl在发育和成人期间作用的分子机制。该项目将阐明mbl表达和功能的重要调节机制,与MD发病机制密切相关的过程。此外,该项目在分析circRNA在生理学和行为中心方面的作用时,在技术和智力上都具有创新性。我们的项目建立在强大的初步成果和我们集团独特且不断发展的专业知识的基础上。




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