RNA甲基化m6A-seq 研究一本通将从m6A是什么，m6A甲基化酶的种类及功能，m6A检测方法汇总，m6A课题设计思路，m6A论文发表梯度推荐，m6A后期验证工具大全到经典案例解析等方面为大家揭开m6A的神秘面纱，每天5分钟，就能从m6A小白入门到高阶提高哦~
往期内容回顾：
RNA碱基修饰以及m6A的前世今生
m6A甲基化酶的种类及功能盘点
m6A甲基化检测方法及优劣势盘点
今天的文章将围绕m6A甲基化相关SCI论文发表要求展开，详细阐述了不同论文中必不可少的写作内容，一起来学习吧~
实验要求：通常 4 分左右的杂志，标配是转录组测序搭配 m6A-seq，最后通过对 m6A-seq 中的数据和图表进行罗列后就能发表一篇小论文了。这一类杂志和文章的要求通常不会含有太多的后期验证实验，基本上是对测序结果进行罗列展示以及配合 qPCR 或 LC-MS/MS 就差不多了。
实验手段：m6A-seq、 转录组测序/表达谱芯片、 qPCR、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、 小 RNA 测序/小 RNA 芯片（可选）。
推荐杂志：BMC Genomics、RNA Biology 等二区/三区杂志。
参考文献：Tao, X., et al. (2017). Transcriptome-wide N6-methyladenosine methylome profiling of porcine muscle and adipose tissues reveals a potential mechanism for transcriptional regulation and differential methylation pattern. BMC Genomics, 18(1), 336.
实验要求：摆脱了罗列测序结果的粗暴做法，这类分数的杂志会要求加入细胞实验，动物实验为可选方案。 通常的做法是对几种甲基化酶进行敲低、敲除和过表达后，进行一系列的细胞实验。同时对几种感兴趣的靶基因进行 qPCR 和 WB 等验证，并对整体 mRNA 的 m6A 水平进行检测。另外，对几种甲基化酶敲低和过表达后，还可以再用测序或芯片等手段来观察究竟哪些基因或小 RNA 受到了影响。
实验手段：m6A-seq、转录组测序/表达谱芯片、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、 小 RNA 测序/小 RNA 芯片、 qPCR、 WB、敲低/过表达、动物实验（可选）。
推荐杂志：Cell Death & Disease 等二区杂志。
参考文献：Warda, A. S., et al. (2017). Human METTL16 is a N6-methyladenosine (m6A) methyltransferase that targets premRNAs and various non-coding RNAs. EMBO Reports, e201744940.
实验要求：在 7 分杂志的要求再上了一个档次与要求，在前面的基础上需要鉴定出究竟哪些靶基因受到了甲基化酶的调控。然后对这些靶基因进行敲除、敲低和过表达实验，观察是否对甲基化酶表达异常的表型能够进行补救。 接下来需要对靶基因上的 motif 进行点突变验证是否真的受到甲基化酶调控。同时 mRNA 在出核速度、半衰期等方面也要进行实验进行佐证。
实验手段：m6A-seq、转录组测序/表达谱芯片、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、小 RNA 测序/小 RNA 芯片、 qPCR、 WB、敲低/过表达、靶基因验证、动物实验（可选）。
推荐杂志：Nature Communications、Nucleic Acids Research、eLife 等一区杂志。
参考文献：Roundtree, I. A., et al. (2017). YTHDC1 mediates nuclear export of N6-methyladenosine methylated mRNAs. eLife,6, e31311.
实验要求：在先前 10 分杂志的基础上加入动物实验。这类文章通常包含几个特点，即物种首次报道，鉴定出新型的蛋白，报道新的通路与机制，阐释临床问题等。这需要研究者们对科学问题有足够的敏感度，在原先的研究基础上进行更加深入的挖掘。
实验手段：m6A-seq、转录组测序/表达谱芯片、 LC-MS/MS 或 m6A 比色法、小 RNA 测序/小 RNA 芯片、 qPCR、 WB、敲低/过表达、靶基因验证、动物实验、临床实验/药物实验。
推荐杂志：Cancer Cell、 Nature Immunology、 Cell 等顶级期刊。
参考文献：Li Z, et al. (2017). FTO plays an oncogenic role in acute myeloid leukemia as a N6-methyladenosine RNA demethylase. Cancer Cell, 31(1), 127.
今天的内容讲完啦，大家记得收藏好慢慢学习哦~
下期预告：RNA 甲基化 m6A 后期验证工具之RNA-RNA/DNA 互作验证及敲低/敲除/过表达
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