优博视界 | 我校2017年优秀博士学位论文获得者张传宝

编者按

首都医科大学优秀博士学位论文评选工作,旨在促进博士学位论文质量提高,培养博士研究生创新能力。2017年,经学院推荐、专家通讯评议和学校学位委员会评审等程序严格遴选,共评选出11篇优秀博士学位论文,涵盖内科学、外科学、儿科学、神经生物学等7个专业。优秀博士学位论文获得者在学期间发表成果表现突出,其中2人在影响因子10.0以上的SCI收录期刊发表论文。本栏目将陆续推出入选论文及作者简介,分享我校博士研究生培养成果。


2017年首都医科大学优秀博士学位论文获得者

张传宝


获奖博士学位论文

论文:

基于高通量数据的间变脑胶质瘤分子分型与生物标记物挖掘

作者:

2014级博士研究生 张传宝

专业:

外科学(神外)

导师:

江涛教授

学院:

北京市神经外科研究所


读博感言

古诗云:“行百里者半于九十”,读完博之后才感觉自己的医学生涯仿佛刚刚启蒙,有太多的未知等待我们去探索。我是站在巨人的肩膀上,感谢恩师、多位老师、师兄弟的积累与无私帮助。


研究背景/选题意义

目前间变脑胶质瘤的分型仍为基于形态学的病理分型(2016年WHO分型中引入了IDH、染色体1p/19q共缺失两个分子病理因素),尚不能全面反映该类型肿瘤的复杂遗传背景,亟需基于高通量数据的分子分型方案。本研究拟通过整合本团队及国际公共数据库的间变脑胶质瘤组织样本的转录组学数据(mRNA芯片/mRNA测序),构建基于转录组数据的分子分型方案。并通过数据筛选与样本验证,获得能反映该分子分型或患者临床预后密切相关的标记物,为开展临床应用奠定基础。


主要研究内容



主要创新点

本研究通过应用转录组测序、mRNA表达谱芯片、SNP芯片、全外显子测序等高通量基因组学研究方法,系统研究了脑胶质瘤,特别是间变性脑胶质瘤的遗传特征,并通过免疫组织化学、PCR等方法加以验证。取得的主要创新成果如下:

  1. 在基因表达谱层面,构建了精简的基于三个基因的间变脑胶质瘤分子分型,该分型可在四个数据库、444例间变脑胶质瘤样本数据中得到有效验证。基于三个基因的分型方案可很好的区分患者临床预后。该高、低危患者与WHO IV级、II级患者具有一定一致性,提示需要给予不同的治疗方案。

  2. 应用pHH3作为间变脑胶质瘤中细胞有丝分裂的标志物。肿瘤有丝分裂指数在间变性脑胶质瘤,特别是Ki-67低表达的肿瘤中有显著的预后价值。在多因素分析中,我们发现pHH3的预后价值是独立于多个临床及分子病理指标的。通过免疫组化数据与高通量数据的整合分析,我们发现了pHH3与EMT的相关性。这表明,通过pHH3分组,可以将患者分为预后和生物学背景不同的亚组,有助于进一步阐明脑胶质瘤复杂遗传背景,为开展脑胶质瘤病因及恶性进展机制研究提供了新的思路。

  3. 通过对4个数据库、2249例脑胶质瘤、29例正常对照及4例脑胶质瘤细胞瘤表达谱数据的分析,我们计算得出基于ESTIMATE算法的样本纯度信息。进一步研究发现肿瘤细胞纯度与脑胶质瘤临床特征、基因组学特征和生物学行为具有显著相关性。判断肿瘤的细胞纯度,可辅助解析复杂的肿瘤微环境,进一步阐明了非肿瘤细胞在脑胶质瘤分型的重要价值,对脑胶质瘤临床诊疗具有重要意义。


代表性研究成果

1. an Underlying Key Factor in Glioma. Clin Cancer Res, 2017. 23(20): 6279-6291. IF:9.25

2. P Zhu#, C B Zhang#, P Yang, J Chen, Y Q Liu, H M Hu, H Huang, Z S Bao, W Zhang, W J Kong*, and T Jiang*, Phosphohistone H3 (pHH3) is a prognostic and epithelial to mesenchymal transition marker in diffuse gliomas. Oncotarget, 2016. 7(29): 45005-45014. IF:5.312

3. C B Zhang#, P Zhu#, P Yang, J Q Cai, Z L Wang, Q B Li, Z S Bao, W Zhang, and T Jiang*, Identification of high risk anaplastic gliomas by a diagnostic and prognostic signature derived from mRNA expression profiling. Oncotarget, 2015. 6(34): 36643-36651. IF:5.312

4. Z Wang#, Y Hao#, C Zhang#, Z Wang, X Liu, G Li, L Sun, J Liang, J Luo, D Zhou*, R Chen*, and T Jiang*, The Landscape of Viral Expression Reveals Clinically Relevant Viruses with Potential Capability of Promoting Malignancy in Lower-Grade Glioma. Clin Cancer Res, 2017. 23(9): 2177-2185. IF:9.25

5. W Cheng#, C Zhang#, X Ren, Z Wang, X Liu, S Han, and A Wu*, Treatment strategy and IDH status improve nomogram validity in newly diagnosed GBM patients. Neuro Oncol, 2017. 19(5): 736-738. 7.138


导师指导感言

很喜欢Ray Kroc的那句话:“The more I help others to succeed,the more I succeed”。做导师很有意义,当看到自己的学生一个个成功时,同样会有成功的愉悦感。这其中,既有学生自己的辛勤汗水,又有周围人的合作帮助。希望我帮学生树立的,是良好的团队协作精神与积极进取的人生态度。

内容转自“首都医科大学研究生教育”微信公众号


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