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基础研究|广东科学家在进化基因组学领域发表高水平论文

广东基础研究2019-04-21 06:35:20



近日,华南农业大学群体微生物研究中心周筱帆教授在国际著名期刊Molecular Biology and Evolution上发表题为“Evaluating Fast Maximum Likelihood-Based Phylogenetic Programs Using Empirical Phylogenomic Data Sets”的研究论文。

对基因和物种间进化关系的正确认识构成了进化和比较基因组学研究的重要基础。而面对海量的基因组数据,分析工具和策略的选择对于结果的准确性以及研究的效率都具有至关重要的影响。这项研究利用大量的基因组和转录组数据,对RAxML,IQ-TREE,PhyML,和FastTree等四种进化分析方面最常用的软件工具进行了系统深入的比较,详细分析了它们在单基因分析,以及基于“串联法”或“溯祖法”的系统发育基因组分析中的表现和各自的优缺点。研究结果为今后的系统发育基因组学研究提供了重要参考。

该文章发表后迅速获得广泛关注,Altmetric得分达79,位于所有同期发表论文的前3%,并且获得国际权威学术评议机构Faculty of 1000的推荐,表明该文章具有较高的社会影响力和学术价值。