3月8日，中国两位病毒学家应邀在国际顶级学术期刊《Cell》上发表评述文章，一为中国疾病预防控制中心高福院士撰写的评述文章“From ‘A’IV to ‘Z’IKV: Attacks from Emerging and Re-emerging Pathogens”，用生动的语言和详实的数据系统地评述了全球新发突发传染病形势及应对策略（点此回顾）。二为复旦大学，中国疾病预防控制中心的张永振教授，张教授介绍了宏基因组学在大规模发现与研究新病毒方面的重要作用，尤其是宏转录组测序可能是目前最佳的RNA病毒发现方法。
2016年底张教授团队在《Nature》发表论文，使用宏转录组分析从无脊椎动物中发现一千四百余种新RNA病毒，大大改变了我们对RNA病毒圈的认识，包括RNA病毒组成、进化、起源、基因组结构以及与宿主的关系，弥补了以往病毒分类中存在的大量间隙。其中一些病毒与现有已知病毒的差异性之大，以至于需要重新被定义为新的病毒科。
相对于其他生命体来说，我们对病毒所知甚少，但是病毒对我们身体健康，甚至经济发展，社会稳定等都能产生巨大影响。通过传统的细胞培养来扩增病毒或者PCR鉴定，现在我们对病毒的认识只是冰山之一角，将来广泛的取样（涵盖尽可能多的物种与生存环境）和充分的宏基因组和宏转录组分析必将进一步增进我们对各类病毒的认识。
文章讨论了宏基因组学如何改变了我们对RNA病毒的认识，以及目前存在的一些挑战，包括不同病毒基因组“暗物质”的鉴别。我们对病毒在病毒之间、病毒与微生物及宿主之间如何发生关系，以及这些关系是否影响疾病发生缺少深入认识。对我们来说，分析这些大规模的甚至是生态系统层面的相互作用可能是病毒圈研究中最令人兴奋的领域了，而宏基因组学/宏转录组学可能就是一把“利器”。
什么是宏基因组学：
宏基因组学是以环境样品中微生物群体基因组为研究对象，采用功能基因筛选和测序分析等研究工具，从不可培养微生物中来寻找新基因或开发新生物活性物质。宏基因组学的产生使人们摆脱了物种界限，克服了传统微生物培养方式的缺陷，扩大了微生物资源的利用，掀开了环境微生物研究的新篇章。
参考资料：Cell官网，中国疾病预防控制中心
编辑：ipsvirus