圣迈克:学生协作合著发表DNA数学研究论文


圣迈克学生合著DNA数学研究论文 St. Mike's students co-author DNA math research paper


两名圣迈克的学生和最近的毕业生合著了一篇最近被同行评议的 “数学化学” 杂志接受的学术论文。


学院数学系的Jo Ellis-Monaghan说:“这里的学生做得非常好,计算机科学系的Greta Pangborn是他们研究的合作者和指导者。合著者是目前圣迈克的四年级学生Rebecca Rouleau '18和Anna Cook '18,以及最近的毕业生Alana Houlihan '17。


这三个人在2016年夏天一起工作,并在明年进行了一些后续工作,这些工作是由来自许多由埃利斯 - 莫纳汉和潘邦指导的圣迈克学生进行的广泛的持续研究。在过去的十年里,通过与学生的DNA自组装工作,这些教授是圣迈克夏季研究指导的先驱,今天是一个至关重要的,广泛的和扩大的企业。


这个最近的文章是一个真正的文理契合:库克是一个英语专业,而Houlihan和Rouleau是数学专业; 除了圣迈克之外的合作者和合着者是纽约大学的化学家Ned Seeman,DNA自组装的先驱之一,负责第一个成功的装配方法之一,还有数学家Margherita Ferreri,直到最近还是一名研究生意大利米兰理工大学数学系,她的论文工作构成了论文的一部分 - 她现在在佛罗里达大学。


一篇摘要描述了这篇论文的主题:“我们描述半圈模型,一个数学框架,捕捉刚性瓷砖的几何约束,这是分枝连接分子用作基于瓷砖的DNA自组装的基础。该模型不仅捕获瓷砖上粘性端部组的组合结构,而且捕获瓷砖的臂间角度的特定几何形状,并且最关键地粘附瓷砖的相对定向。我们通过提供可证实的最佳DNA自组装策略来构建柏拉图式和阿基米德式3规则多面体骨架来说明模型的功能。


圣迈克数学与统计系主任Ellis-Monaghan和“PRIMUS”杂志主编,关于数学本科研究中的问题,资源和问题的杂志,以更清晰的语言解释了这种技术性探测的背景工作。


她说:“DNA链的特性使得科学家们能够设计DNA,使其能够自组装成复杂的二维和三维结构,用于纳米级电路,机器人和制药等应用。 “然而,从今天的实验室出现的各种装配方法中涉及到许多数学挑战。在一个创新的例子中,这项工作使用木工技术半圈拼接接头作为DNA自组装的理论数学模型的基础,为DNA自组装的科学家提供了可行的最优设计策略。 ”


她表示,自组装数学是一个非常新的领域,“虽然需要刻苦,创造性的思考和严肃的问题制定工作,但是从基本原则来看,还是有很多方面的,所以特别适合大学生参与”她说:“这项工作是高度跨学科的,研究团队(如本文作者)常常包括专业合作者和数学,计算机科学,物理学,生物学甚至英语和艺术的学生。



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